Favoriete organismen
Streptomyces
De streptomyceten zijn een geslacht van grampositieve bodembacteriën die bekend staan om hun vermogen om antibiotica te produceren. Deze filamenteus groeiende bacteriën vertonen een vergelijkbare levenscyclus als schimmels en staan bekend om het produceren veel verschillende enzymen tijdens deze verschillende levensfases [1].
Pseudomonas putida
Pseudomonas putida is een gramnegatieve bodembacterie. Van sommige stammen is bekend dat ze tolerant zijn ten opzichte van stressvolle omgevingen, zoals hoge concentraties organische oplosmiddelen [2].
Escherichia coli
E. coli is een van de werkpaarden in de moleculaire biologie. Ze zijn relatief eenvoudig te modificeren en worden voornamelijk gebruikt als tussenstap tijdens het klonen en eventuele productie van enzymen [3].
Aspergillus niger
Aspergillus niger is een filamenteuze schimmel die het beschimmelen van uien veroorzaakt. Afgezien hiervan is Aspergillus niger een belangrijk biotechnologisch organisme omdat ze in staat zijn een verscheidenheid vannatuurlijke polymeren af te breken [4].
Referenties
Foto 1: Streptomyces korrel, gemaakt door Jo-Anne Verschoor 100x vergroot Leiden 2021.
Afbeelding 2: Pseudomonas putida (Trevisan 1889) Migula 1895 - Leibniz Instituut DSMZ - Duitse verzameling van micro-organismen en celculturen, Duitsland - CC BY-SA. https://www.europeana.eu/nl/item/11637/PROKARYAXDSMZXGERMANYXDSMX26252
Foto 3: E.coli op agar. SEM door David Gregory & Debbie Marshall - Wellcome Collection, Verenigd Koninkrijk - CC BY.
https://www.europeana.eu/nl/item/9200579/y3w38jks
Foto 4: Aspergillus niger groei op agarplaat. https://www.universiteitleiden.nl/en/research/research-projects/science/ibl-improving-the-filamentous-fungus-aspergillus-niger-as-cell-factory-for-starch-degrading-enzymes.
1: Urem et al, 2016 https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/mmi.13464
2: Kusumawardhani et al, 2018 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167779918301203?via=ihub
3: Pines et al, 1999 https://link.springer.com/article/10.1385/MB:12:1:25
4: https://www.universiteitleiden.nl/en/research/research-projects/science/ibl-improving-the-filamentous-fungus-aspergillus-niger-as-cell-factory-for-starch-degrading-enzymes.